Основні етапи розвитку вишу представлені в документах фондів: Ф.Р.502, Ф.Р.302, Ф.Р.3202, Ф.10.
Державний архів Хмельницької області
Ф.Р.582. Кам’янець-Подільський державний український університет. 1512 од. зб., 1918–1921 рр. Перше надходження – 1935 р. Фонд містить унікальні та ОЦД.
Ф.Р.302. Кам’янець-Подільський інститут народної освіти (1921–1930 рр.), Кам’янець-Подільський інститут соціального виховання (1930–1933 рр.), Кам’янець-Подільський державний педагогічний інститут (1933 –1935, 1948–1997 рр.). 16397 од. зб. Перше надходження – 1935 р.
Ф.Р.3202. Кам’янець-Подільський державний учительський інститут. 186 од. зб., 1939–1941, 1944–1952 рр. Уперше документи надійшли на державне зберігання у 1956 р., у 1965 р. – доєднано фонд місцевого комітету профспілки працівників вищої школи і наукових закладів України по Кам’янець-Подільському вчительському інституту за 1944-1948 рр. в кількості 5 од. зб. Документи з управлінської діяльності за 1939-1941 рр. втрачені під час Другої світової війни.
Кам’янець-Подільський міський архів
Ф.10. Кам’янець-Подільський державний педагогічний університет. Кам’янець-Подільський державний університет. Кам’янець-Подільський національний університет. Кам’янець-Подільський національний університет імені Івана Огієнка. 3639 од. зб., 1997 – 2012 (2011 календарний рік та 2011-2012 навчальний рік) рр.
Уперше документи фонду надійшли на державне зберігання у 2006р.
Архів Кам’янець-Подільського національного університету імені Івана Огієнка:
Ф. Р.3202. Кам’янець-Подільський державний учительський інститут: 1944 – 1950 рр. (документи з кадрових питань (особового складу). Перше надходження документів – 1960 р.
Ф. Р.302. Кам’янець-Подільський державний педагогічний інститут: 1948 – 1997 рр. (документи з кадрових питань (особового складу). Перше надходження документів – 1961 р.
Ф.10. Кам’янець-Подільський державний педагогічний університет. Кам’янець-Подільський державний університет. Кам’янець-Подільський національний університет. Кам’янець-Подільський національний університет імені Івана Огієнка: 1997– 2020 рр. Перше надходження документів – 1998 р.
Документи з моменту створення чи надходження і до передавання на архівне зберігання зберігають децентралізовано за місцем формування справ у структурних підрозділах відповідно до номенклатури справ.
Зміни у складі та обсязі фондів університету відбуваються шляхом проведення експертизи цінності документів та передавання справ на постійне зберігання.
Передано на постійне зберігання:
в державний архів Хмельницької області документи фонду Р.582 «Кам’янець-Подільський державний український університет» (1918-1921 рр.), фонду Р.3202 «Кам’янець-Подільський державний учительський інститут» (1939-1941, 1944-1952рр.), фонду Р.302 «Кам’янець-Подільський державний педагогічний інститут» (1920-1935, 1948-1997 рр.),
в Кам’янець-Подільський міський архів документи постійного зберігання фонду 10: Кам’янець-Подільського державного педагогічного університету, Кам’янець-Подільського державного університету, Кам’янець-Подільського національного університету, Кам’янець-Подільського національного університету імені Івана Огієнка (фонд 10) за 1997- серпень 2012 (2011 календарний рік та 2011-2012 навчальний рік) рр.